В д-знавстві існують спеціальні методи (уніфікації, стандартизації, мінімізації) шляхів і процедур д-обігу, одноразовості у документуванні, відборі при експертизі. Єдність всії цих методів складає методологію д-знавства. Методологія – сукупність підходів, способів, методів, прийомів і процедур, застосовуваних у пізнавальному процесі й практичній діяльності.
Методологічні засоби можуть розглядатися горизонтально та вертикально. Горизонтальну структуру складають методи одного рівня, пов’язані між собою координаційними зв’язками, а вертикальну – методи, які підпорядковані один одному.
Вертикальну структуру методів утворюють: загальні філософські (методи формальної логіки, діалектики); загальнонаукові (метод конкретних досліджень, кількісні методи); загальногуманітарні (генетичний, системний, статистичний та ін. методи); спеціальні методи (текстологічні, джерелознавчі та ін.).
Методи мають пізнавальну силу лише тоді, коли їх адаптовано до конкретних завдань і вимог. Вибір методів документознавчих досліджень залежить від дослідницького рівня: емпіричного (властиві методам спостереження, описування, аналізу та синтезу) чи теоретичного (генетичний, типологічний, системний, структурний, функційний, аксіоматичний, методі сходження від абстрактного до конкретного, моделювання, абстрагування та ін.)