МАРК РЕГНЕРУС ДОСЛІДЖЕННЯ: Наскільки відрізняються діти, які виросли в одностатевих союзах
РЕЗОЛЮЦІЯ: Громадського обговорення навчальної програми статевого виховання ЧОМУ ФОНД ОЛЕНИ ПІНЧУК І МОЗ УКРАЇНИ ПРОПАГУЮТЬ "СЕКСУАЛЬНІ УРОКИ" ЕКЗИСТЕНЦІЙНО-ПСИХОЛОГІЧНІ ОСНОВИ ПОРУШЕННЯ СТАТЕВОЇ ІДЕНТИЧНОСТІ ПІДЛІТКІВ Батьківський, громадянський рух в Україні закликає МОН зупинити тотальну сексуалізацію дітей і підлітків Відкрите звернення Міністру освіти й науки України - Гриневич Лілії Михайлівні Представництво українського жіноцтва в ООН: низький рівень культури спілкування в соціальних мережах Гендерна антидискримінаційна експертиза може зробити нас моральними рабами ЛІВИЙ МАРКСИЗМ У НОВИХ ПІДРУЧНИКАХ ДЛЯ ШКОЛЯРІВ ВІДКРИТА ЗАЯВА на підтримку позиції Ганни Турчинової та права кожної людини на свободу думки, світогляду та вираження поглядів Контакти
Тлумачний словник |
|
|||||||
Контінги перективаються рестриеційними фрагментамиЗа і проти велико-вставочних векторів Лямбда фаги і косміди -Стабільні вставки -Але розмір вставок надто малий для проектів великомасштабних секвенувань YACs -Найбільші розміри вставок -Але важко з ними працювати Вставка розмірів фага лямбда і косміди векторів (показано на схемі на слайді) занадто малі для масштабних проектів секвенування, навіть якщо їх вставки, як правило, дуже стабільні при розмноженні бактерій. Хоча можна було б собі уявити, що YACs, мають вставки великих розмірів , цей вектор можна обрати для секвенування геному, але з ними досить важко працювати.Проблеми полягають у виділенні штучних хромосом від нормальних хромосом дріжджів і проблеми зі стабільністю великих вставок. Слайд 20 BACs ii PACs Вектори, що найчастіше використовуються для великомасштабних секвенувань Гарний компроміс між розміром вставки і легкістю використання Ріст і ізоляція аналогічні до плазмід Таким чином, хоч BACs і PACs не утримують великих вставок, але вони найбільш часто використовувальні вектори для великомасштабного секвенування. Вони являють собою гарний компроміс між розміром вставки і простоти використання. Зокрема, зростання та ізоляції цих векторів для клонування аналогічна для бактеріальних плазмід. Діаграма на цьому слайді - типовий вектор клонування BAC, показані різні сайти рестрикції для клонування і початку реплікації Слайд 21 Контіг (от англ. contiguous) — набор перекрывающихся фрагментов ДНК, которые в совокупности представляют собой консенсусную область ДНК) - це групи частин хромосомної ДНК, що перекриваються -Утворюють суміжні клони Для секвенування хочуть створити "мінімальний шлях доріжки" “minimum tiling path” Контінг є найменшими вставками, які охоплюють області хромосоми
Перекриваються фрагменти ДНК, які охоплюють області хромосоми відомі як "контінги", термін, походить від "суміжних" “contiguous,”, продукуючи безперервну послідовність фрагментів ДНК. Для ефективної послідовності, метою є почати з найменшою кількістю фрагментів ДНК, які утворюють контіг, що охоплюють області хромосоми, потрібної послідовності. Цей набір фрагментів відомих як "мінімальний шлях доріжки".
- Вирізають вставки рестриктазами - Шукають подібні рестрикційні фрагменти – відомі як фінгерпрінги - Рівняються перекриттям фрагментів - Подовжуються коли контінг збудований
Є кілька способів отримання контігів. Один з них, щоб скоротити всі доступні вставками (від косміди, BACs, PACs, абр YACs) з різними ферментами і порівняти структуру групп що генеруються. Коли кілька смуг по всій довжині, такого ж розміру в двох різних вставках, це означає, що два фрагменти перекриваються. Цей процес відомий як «відбитки пальців» фінгерпрінги. Послідовність цього процеса може бути повторена до контіга потрібна довжина, що генерується.??? Читайте також:
|
||||||||
|