Для циклоалканів, у циклах яких містяться два замісники, можлива також геометрична і оптична ізомерія.
Геометрична(цис-, транс-ізомерія) властива двозаміщеним циклоалканам, у молекулах яких замісники розташовані біля різних вуглецевих атомів циклу:
цис-1,2-диметилциклопропан (Z-ізомер)
транс-1,2-диметилциклопропан (Е-ізомер)
Така ізомерія зумовлена неможливістю переміщення замісників з одного боку циклу на другий без розриву одного із зв’язків у циклі.
Оптична ізомерія властива для двозаміщених циклоалканів, у молекулах яких замісники в циклі знаходяться біля різних вуглецевих атомів. Так, у молекулі циклопропандикарбонової кислоти атоми вуглецю, сполучені з карбонільними групами, є асиметричними. Молекула транс-1,3-циклопропандикарбонової кислоти не має площини симетрії і тому ця речовина існує у вигляді двох оптичних ізомерів (енантіомерів І і ІІ), які обертають площину поляризації світла (один праворуч, другий ліворуч) на однаковий кут ±84,5 °: