Заступник начальника регіональної митниці, митниці
Відділ митних інформаційних технологій;
Відділ оперативних чергових;
Господарсько-експлуатаційний відділ;
Митні пости, відділи митного оформлення
Наказом ДМСУ № 1026 від 05.12.2011 «Про затвердження граничної чисельності працівників митних органів, спеціалізованих митних установ та організацій» затверджені відповідні штатні розписи.
З метою оптимізації чисельності митних органів, ефективного та якісного виконання завдань та функцій, покладених на митну службу України, здійснено функціональне об'єднання окремих підрозділів митниць.
При формуванні штатного розпису митниці слід враховувати, що штатна чисельність відділів не може бути менше, ніж 5 одиниць, а секторів – 2 одиниці.
Сектор утворюється як самостійний підрозділ, так і у складі іншого самостійного підрозділу понад мінімальну чисельність працівників цього підрозділу (не менше 7 одиниць).
При цьому, питання доцільності створення секторів у складі підрозділу повинно розглядатися у залежності від складності та різносторонності завдань, що виконуються відділом.
Посада заступника керівника підрозділу вводиться при наявності у ньому не менше 7 штатних одиниць.
Митні пости, які з набранням чинності новою редакцією Митного кодексу України набудуть статусу відокремлених структурних підрозділів створюються як у пунктах пропуску через митний кордон України, так і поза такими пунктами пропуску.
До складу митного поста можуть входити відділи та сектори митного оформлення. Самостійні відділи митного оформлення можуть створюватися у разі їх розміщення за однією поштовою адресою з митницею.
До складу митних постів, відділів митного оформлення не можуть бути включені посади, якими забезпечуються функції підтримки (господарсько-експлуатаційні, організаційного та документального забезпечення, кадрової роботи, правового забезпечення, фінансів, бухгалтерського обліку та звітності, захисту державної таємниці та спеціального документального зв’язку, охорони праці, мобілізаційної роботи та цивільної оборони, протидії корупції, зв’язків з громадськістю).