В липні 2009 року у Верховній Раді України був зареєстрований законопроект про внесення змін до закону про оперативно-розшукову діяльність, яким посилюються повноваження прокуратури під час проведення оперативно-розшукових дій. Автор законопроекту пропонує надати право прокурору вносити протест на постанову суду про дозвіл або відмову на проведення оперативно-розшукових заходів. Ці пропозиції були піддані активній критиці з боку громадянського суспільства, оскільки такі положення порушують європейські стандарти щодо незалежності та невтручання в діяльність судової гілки влади. Комітет з питань європейської інтеграції, взявши до уваги також позицію Венеціанської Комісії про те, що "винесені судом рішення не повинні бути предметом будь-якого перегляду поза межами апеляційного процесу, зокрема через застосування процедури протесту прокурора або будь-якого іншого органу поза межами часових строків, встановлених для апеляції" прийшов до висновку, що ця вимога спрямована на усунення можливості здійснення позасудового скасування чи зміни рішення, винесеного судом у справі і саме апеляційна процедура здатна забезпечити дотримання цих вимог, оскільки тоді рішення про скасування (перегляд) винесеного судом рішення приймається в межах самої судової системи, іншим судовим органом. Таким чином забезпечується захист судової системи від зовнішнього втручання в її функціонування та неналежного впливу на неї. Тому комітет рекомендував, щоб положення Проекту були переглянуті в частині передбаченої ними процедури оскарження рішення суду через процедуру протесту. Ця процедура повинна бути виключена та замінена на звичайну апеляційну процедуру – як процедуру, що не передбачає жодних екстраординарних повноважень щодо оскарження винесеного судом рішення чи застосування жодних надзвичайних процедур його оскарження та/чи скасування. Комітет з питань європейської інтеграції також запропонував головному комітету (Комітету з питань законодавчого забезпечення правоохоронної діяльності) рекомендувати Верховній Раді України направити на доопрацювання вищезазначений проект Закону як такий, що суперечить міжнародно-правовим зобов’язанням України. Розгляд законопроекту у Верховній Раді України перенесено на невизначений час.