Тепер познайомимося з деякими конкретними уявленнями про чинники транскрипцій і репресорів. Почнемо із загальних чинників транскрипції.
Як відзначалося, це такі чинники транскрипцій, які потрібні для зв'язування РНК-полімерази з промотором, причому які самі теж взаємодіють з промотором.
Ми вже згадували, що у складі промоторів є деякі характерні послідовності нуклеотидних пар, названі боксами. Найчастіше (у 80 % промоторів еукаріот) зустрічається ТАТА-бокс; дещо рідше - ГЦ-, ЦААТ-и інші бокси. Черговість їх розташування в різних промоторах неоднакова: в одних випадках ГЦ-бокс передує ТАТА-боксу (як показано на мал), в інших - навпаки, слідує після нього.
У області ТАТА-боксу з промотором спочатку зв'язується т. з. ТВР-білок (від TATA - Binding Protein). Це ініціює приєднання декількох (восьми або більш) TAF -белков (від ТВР- Associated Factors).
Ці білки - ТВР і TAF - і називаються загальними факторами транскрипції, оскільки присутні в усіх клітинах і абсолютно необхідні для транскрипції більшості генів.
Комплекс цих білків коротко позначають TFIID (Transcriptional Factor D for polymerase II). З позначення слідує, що ці білки потрібні для зв'язування з промотором рНК-полімерази II. Разом з нею сукупність усіх цих білків, пов'язана з промотором, називається основним ініціаторним комплексом.
Якщо ж ген транскрибується РНК-полімеразою I або III, його промотор містить замість ТАТА-боксу іншу послідовність і використовуються інші чинники транскрипції.
Окрім загальних чинників, для ефективної роботи гена потрібні і інші білки. Так, з ГЦ-боксом промотора зв’язується Spl-білок, з ЦААТ-боксом - ще один білок. Відомі і такі транскрипції коактиватори, як білки СВР і р300. Комплекс р300/СВР ацетилює гістони. Можливо, це сприяє витісненню з промоторної області ДНК нуклеосом і тим самим забезпечує саму можливість формування основного ініціаторного комплексу.
Більш тонша регуляція активності гена здійснюється іншими чинниками транскрипцій - тими, які зв'язуються поза промотором, тобто з енхансерами.