Студопедия
Новини освіти і науки:
МАРК РЕГНЕРУС ДОСЛІДЖЕННЯ: Наскільки відрізняються діти, які виросли в одностатевих союзах


РЕЗОЛЮЦІЯ: Громадського обговорення навчальної програми статевого виховання


ЧОМУ ФОНД ОЛЕНИ ПІНЧУК І МОЗ УКРАЇНИ ПРОПАГУЮТЬ "СЕКСУАЛЬНІ УРОКИ"


ЕКЗИСТЕНЦІЙНО-ПСИХОЛОГІЧНІ ОСНОВИ ПОРУШЕННЯ СТАТЕВОЇ ІДЕНТИЧНОСТІ ПІДЛІТКІВ


Батьківський, громадянський рух в Україні закликає МОН зупинити тотальну сексуалізацію дітей і підлітків


Відкрите звернення Міністру освіти й науки України - Гриневич Лілії Михайлівні


Представництво українського жіноцтва в ООН: низький рівень культури спілкування в соціальних мережах


Гендерна антидискримінаційна експертиза може зробити нас моральними рабами


ЛІВИЙ МАРКСИЗМ У НОВИХ ПІДРУЧНИКАХ ДЛЯ ШКОЛЯРІВ


ВІДКРИТА ЗАЯВА на підтримку позиції Ганни Турчинової та права кожної людини на свободу думки, світогляду та вираження поглядів



Контакти
 


Тлумачний словник






Гібридний підхід

Суперечка: Секвенування на основі картування проти секвенування цілого геному методом дробовика

Celera використовувала публічні вже відомі послідовності, щоб виробляти свої для проекту Генома Людини

Вчені, які працювали на секвенуванні на основі картування стверджують, що Celera не могла підготувала проект без доступу до вже відомих послідовностей послідовності

Вчені Celera стверджують, що вони могли б зробити точний проект навіть без вже відомих послідовностей

Відношення секвенування на основі картування і секвенування цілого генома методом дробовика як і раніше є досить спірним. У своїй опублікованій чернетці Геному Людини, Celera мали доступ і використовували вже відомі послідовності Проекту Генома Людини. Деякі з учених, які працювали з секвенуванням на основі картування стверджують, що Celera ніколи не могла би зібрати послідовності без доступу до цієї інформації. Вчені Celera заперечували, що вони могли б дійсно зробити зібрати без вже відомих послідовностей і, по суті, збірка була б більш точною і лише трохи менше обширною.

Поєднує в собі аспекти як секвенування на основі картування і секвенування цілого генома методом дробовика

Карта клонів

Послідовність деяким з зіставлених клонів

У цілому геномі

Об'єднання інформації з обох методів

Використання послідовності з картованих клонів, як ешафот, щоб зібрати читання методу дробовика всього генома

Використовується для секвенування геному миші

Один із способів вирішення спорів в тому, щоб поєднати ці два підходи. Цей гібридний підхід починається з фізичного картування , а також секвенування деяких з клонів в найкоротший шлях доріжки. У той же час, виконується секвенування цілого геному. Потім інформація поєднується з використанням послідовності з картованих клонів, як ешафот, щоб допомогти зібрати читання методу дробовика всього геному. Цей підхід був використаний для секвенування генома миші.

Можна знову використати книгу як аналогію, в гібридному підході, порядок визначається обсягами і невеликою кількістю інформації від кожного придбаного обсягу. У той же час, випадкові фрагменти від усіх обсягів читати. Ці випадкові фрагменти потім вирівнюється за допомогою інформації, отриманої при замовленні обсягу і невелика кількість інформації відомої про кожний том. По суті, випадкові фрагменти використовуються для заповнення прогалин, які залишаються, коли інформація з окремих томів збирається. На графіку в правому нижньому кутку цього слайда зображено відкрите питання про те, що поєднання секвенування цілого генома методом дробовика і секвенування на основі картування є оптимальним.


Читайте також:

  1. III етап. Системний підхід
  2. IV етап. Ситуаційний підхід
  3. Аксіологічний підхід до вивчення педагогічних явищ.
  4. Алфавітний підхід до вимірювання кількості інформації.
  5. Асимптотичний підхід до порівняння оцінок
  6. Багатоаспектний підхід до прийняття управлінськихрішень
  7. Багаторівневий підхід. Протокол. Інтерфейс. Стек протоколів.
  8. Витратний підхід
  9. Віковий підхід і взаємодія різних рівнів соціального досвіду в діяльності різновікових дитячих об’єднань. Функції різновікової групи.
  10. Глобалітсика і глобальний підхід у науці
  11. Даний підхід передбачає, що покупець не заплатить за об»єкт суму, більшу вартості відомої йому власності, що має таку ж корисність.




Переглядів: 422

<== попередня сторінка | наступна сторінка ==>
Метод дробовика секвенування цілого геному 3 | Секвенування параметрів

Не знайшли потрібну інформацію? Скористайтесь пошуком google:

 

© studopedia.com.ua При використанні або копіюванні матеріалів пряме посилання на сайт обов'язкове.


Генерація сторінки за: 0.002 сек.